В данном случае бюджетное учреждение должно уплатить штраф за счет средств субсидии (по КФО 4). Например, за счет экономии средств субсидии, если расходы на уплату штрафа не предусмотрены в плане ФХД. В этом случае в план ФХД нужно внести соответствующие изменения. Подробнее.