Внутренний документооборот организации регулируется локальными актами организации, электронный документооборот с контрагентами регулируется, в частности, соглашением между сторонами.
Электронный документооборот в сфере трудовых отношений регулируется ТК РФ, при этом необходимость перехода на такой документооборот оценивает работодатель.
Подробнее.

В помощь бухгалтеру:

 Готовое решение: Как организовать электронный кадровый документооборот в организации 

 Типовая ситуация: Электронный кадровый документооборот: как перейти и применять 

 Форма: Положение об электронном документообороте

 Форма: Соглашение об электронном документообороте